bgmt: (Default)
Очень разумное замечание. С моей точки зрения, иллюстрирует разницу в методологии точных наук и soft sciences.

Читая "Слепого часовщика" Ричарда Докинза, наткнулась у него на очаровательный образец жанра "ляпы мэтров". Он иллюстрирует свою теорию эгоистичного гена на примере бобров. Логика рассуждений следующая: генетическая мутация чуть-чуть меняет определённую область мозга бобра, из-за чего бобр при плавании выше держит голову над водой, а значит, меньше вероятности, что с ветки, которую он держит в зубах, смоется грязь, а значит, ветка лучше прилипнет к хатке или плотине и т.д.
Всё изумительно, только Докинз, похоже, не затруднился знакомством с реальным поведением бобров даже по литературе. (Он, правда, и сам проговорился, что условно экстраполировал на бобров данные по... нематодам). Что не так с его рассуждением? Да всё.

1. Бобры не плавают, держа голову над водой. Как и выдры, выхухоли, утконосы, бегемоты и т.д. Держать голову над водой анатомически неудобно и энергетически неэффективно (даже люди, занимающиеся профессиональным плаванием, окунают лицо в воду). Я наблюдала, как плавает дикий бобр в природе - его и разглядеть-то непросто, если не караулить заранее, во все глаза наблюдая за водной гладью.

2. Как правило, бобры не подбирают ветки в грязи, а откусывают их с поваленного дерева или кустарника. На свежесрезанных ветках никакой грязи чаще всего не бывает даже в дождливую погоду.

3. Грязь для цементирования бобры наносят сами. На уже уложенные ветки.

Перед нами классический пример, когда из-за неверной посылки - "бобрам нужно держать голову над водой при плавании" - всё рассуждение теряет смысл. (Впрочем, тут неверная посылка даже не одна, а больше).

Может быть, прежде чем рассуждать о влиянии генов на поведение, стоит всё-таки получше изучить само поведение? И не только нематод в лаборатории или школьников в психологических экспериментах...




АПДЕЙТ
Тут мне фильмик прислали. Внизу, в комментах, но я его сюда тоже помещу. Спасибо Майбороде и бобру.
https://videohive.net/item/beaver-swimming-underwater-2/1583183
bgmt: (Default)

С неделю назад я поместил пост в ФБ, просто отсылая к этой статье. Реакции было ровно ноль. По-видимому, это связано с полным незнанием соответствующих реалий, а прочесть статью по-английски гражданам было лень. Поэтому давайте я вкратце объясню.

Я учился в Америке в аспирантуре, в Брауне, с 79 по 84 год. Условия были ровно те же, что сейчас. В точных науках и инженерии аспирантура была в конечном счёте не только бесплатна, но и существовала стипендия; но оформлено это было так, что ты как бы платил университету колоссальную сумму tuition, тебе как бы платили меньшую колоссальную (по представлению graduate students) сумму в форме либо зарплаты teaching assistant (ассистента), или research assistant (научного работника без степени), либо в форме гранта, и небольшая разница - в 79 году это было 600 долларов в месяц - выплачивалась на руки, чтобы жить. Университет обеспечивал равенство (на каждом факультете) именно выплачиваемой на руки суммы.

Система была прекрасна. Деньги были маленькие, многие снимали жильё вместе, но этих денег хватало.  

Налоги платились с той суммы, которую аспирант получал на руки. Т.е. они были очень малы.

Сейчас, как тут пишется, Палата представителей приняла закон о том, что налогообложению подлежит не выплачиваемая аспиранту сумма, а та сумма, из которой вычитается tuition. Т.е. , скажем, аспирант MIT должен будет платить на примерно 10 тысяч долларов в год больше налогов, чем сейчас.

Этих денег у большинства просто нет. Тем более их нет у иностранцев, которые - те, кто идёт на математику, физику или mechanical engineering и т.п. - никак не происходят из богатых семей. Тут надо добавить вещь, которая не особенно широко известна, хотя многократно публиковалась: США не обеспечивают себя людьми с PhD, американцы по большей части предпочитают более короткое и более выгодное в смысле грядущих зарплат или доходов образование. Научное превосходство США держится на том, что туда приезжают учиться и остаются. Вот это-то и собирается уничтожить принятый закон - если, конечно, он будет принят обеими палатами и подписан президентом, но президент-то - Трамп... 

Уничтожить науку в стране - раз плюнуть. Это удалось Тэтчер (и поэтому не надо её хвалить в моём присутствии!), но в Англии кое-как наука восстановилась: когда в науку в Англии снова пошли деньги, многие англичане вернулись из Америки и других стран. В Германии наука не восстановилась после войны, немцы - не убитые - остались в Америке. Ничего общего между местом Германии в научном мире в начале тридцатых и сейчас - нет. Что будет с Россией, гадайте сами. В данный момент научный центр мира в большинстве точных дисциплин - Америка. Если это перестанет так быть, будет очень худо, заменить её некому. 
bgmt: (печать)
Я уж думал, что ничего хорошего к Рождеству вообще не случится. Как-то оно густо нынче на плохое. Но случилось. Два схожих события:

Журнал Nature включил создателя пиратского сайта с научными статьями в список людей года

(хотя вообще-то по-русски женщина-создатель всё же называется создательницей)

и

Немецкие научные библиотеки объявили бойкот всем журналам Elsevier,

Первое из них, безусловно, возмутит толпу граждан российского происхождения или проживания, которые уверены, что все беды в России от несоблюдения законов, а хорошо там, где все законы святы. Я рад, что они возмутятся, люблю дразнить гусей, особенно когда гуси заполонили всё пространство и считают себя главными птицами..

Вот если б ещё американские университеты объявили бойкот издательствам типа Pearson, которые выпускают каждый год новое издание каждого учебника - но не с исправленными ошибками, а с заменёнными номерами упражнений, другими номерами страниц и пр., чтобы трудно  было пользоваться прошлогодним изданием. Учебник при этом весит килограмм пять. Ну подождём, может и объявят.
bgmt: (печать)
[livejournal.com profile] shvarz - человек, который умеет писать о биологии так, что я понимаю. Рекомендую.
==============================================
Originally posted by [livejournal.com profile] shvarz at Вырезание генома ВИЧ
[livejournal.com profile] pharmazevt попросил прокомментировать две недавно опубликованные работы, о которых писали в новостях:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27194423
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26939770

Как наверно все уже слышали, несколько лет назад у бактерий была обнаружена антивирусная система CRISPR. В новостях она мелькает потому что оказалось что она умеет очень специфично найти и порезать кусок ДНК любой заданной последовательности. Причем работает не только в бактериях, но и например в человеческих клетках.

Авторы статьи решили попробовать натравить эту систему на ВИЧ. ВИЧ, как и прочие ретровирусы, попадает в клетку в виде РНК, на ее основе синтезирует ДНК, и потом встраивает эту ДНК в случайном месте в человеческом геноме. Долгое время считалось, что процесс этот необратим - раз уж геном ВИЧ встроился в геном клетки, обратно его не вырезать. Но потом народ стал пытаться разработать разные хитрые способы для вырезания и довольно долго мучился пытаясь создать подобную систему с нуля, а тут вдруг раз и нашли уже готовую систему - ей надо только последовательность ВИЧ указать и она сделает что надо.

Естественно, никто пациентам подобное сразу вводить не будет. Сначала авторы попробовали данную систему в клеточной культуре и результаты выглядели очень обнадеживающе. Система, как ей и полагается, резала геном ВИЧ (она тем и хороша, что ей практически пофигу что именно резать). Более того - клетки становились устойчивыми к последующим попыткам заразить их ВИЧ. Об этом была первая статья выше.

Следующим шагом (вторая статья) решили попробовать то же самое на животных - мышах и крысах. Живой организм отличается от клеточной культуру тем, что до клеток в нем надо еще суметь добраться. Система работает, когда она уже внутри клетки, но как сделать так, чтобы она внутри этой клетки оказалась? Авторы решили использовать вирус AAV, который можно модифицировать так, что он становится одноразовым средством доставки любого небольшого гена в заражаемую клетку. Вирус "жив" ровно один цикл репликации - доставляет нужный ген в клетку и дальше не распространяется. В данном случае в него встроили систему CRISPR и инструкции, нацеливающие ее на ВИЧ.

Для тестирования вируса авторы создали трансгенных мышей и крыс, которые несли во всех клетках своего организма кусок генома ВИЧ. Сначала они протестировали свой вирус на клетках полученных из этих трансегенных мышей, в клеточной культуре. Честно говоря, меня результаты совершенно не впечатлили - ну да, можно видеть, что в очень небольшом проценте клеток система сработала, но в подавляющем большинстве клеток ВИЧ остался в целости и сохранности. Что именно произошло на этой стадии мне из статьи осталось непонятно, но почему-то эффективность оказалась очень низкой. То ли дело в вирусе, то ли в мышах, то ли в их комбинации.

На этой стадии возможно стоило остановится, но видимо вирус уже был готов, мыши и крысы тоже, и поэтому авторы продолжили эксперимент. Они ввели свой вирус мышам и крысам (дважды), потом распластали их на кусочки и посмотрели что случилось с фрагментами ВИЧ. Как и следовало ожидать, в небольшом проценте клеток ВИЧ оказался порезанным. Это неплохое подтверждение принципиальной возможности такого подхода. Что отдельно стоит отметить - они ввели вирус в хвост, а порезанный ВИЧ нашли и в клетках крови, и в сердце, и в печени, и в мозге. Везде в небольших количествах, но везде. Доовльно круто.

Суммируя - очень хороший шаг в интересном направлении, но данный пример скорее можно использовать как пример того, что хорошей теоретической идеи далеко не всегда достаточно, часто после этого нужны годы и годы работы, чтобы довести хорошую идею до практического результата. И путь всегда непредсказуем, проблемы появляются в самых неожиданных местах и задерживают разработку на годы и миллионы долларов.

P.S: На схожей ноте, видел недавно результаты попыток экспрессировать с помощью AAV антитела широкого спектра действия - тоже довольно неудачные, почему-то не экспрессируются в детектируемых количествах.
bgmt: (печать)
До того как стать экономистом, я изучал динамические системы на кафедре дифференциальных уравнений матмеха СПбГУ. Экономику я рассматриваю как динамическую, эволюционирующую систему.

Довольно интересная, хотя в части, как мне показалось, тривиальная статья об экономике с точки зрения физика. Возможно, тривиальности здесь не избежать, потому что - по-видимому - очень мало людей понимает, почему это так сложно изучать.
bgmt: (печать)
К посту http://bgmt.livejournal.com/1002486.html, тому, где фотография участников сольвеевской конференции.

Уже отвечая на комменты, я набрёл на вот этот разговор математика и физика. Так случилось, что в ЖЖ я с обоими, независимо, разругался. (Поэтому я и не видел этого поста и, соответственно, не мог его помнить). Это не мешает мне оценить качество разговора. Я думаю, он кому-то будет очень интересен.
bgmt: (печать)
Лекция Людвига Фаддеева «Математика – шестое чувство физики»

Кстати, там ещё ссылка на полный текст его книги "Лекции по кв. механике для студентов-математиков", сделанной по его лекциям на матмехе 1968-1973 гг.

bgmt: (печать)
Есть такой журнальчик, The New Scientist. Почему я оказался подписан на его рассылку, я не знаю. Как-то случилось. Популярный научный журнал, хорошее дело.
Один раз уже я был сильно удивлён, когда увидел статейку, где сообщалось, что в мозгу есть специальное устройство, задерживающее обработку зрительного сигнала, чтобы учесть тот факт, что скорость света больше скорости звука. Мол, когда ты разговариваешь, то ведь ты видишь движение губ почти сразу, а звук ещё когда дойдёт! И было бы нехорошо, вот и есть задерживающий контур.
Желающим я предлагаю сосчитать размер описываемого эффекта. Для забывших - скорость света 300000 км/сек, звука - 330 м/сек, на каком расстоянии у вас обычно собеседник, сами сообразите.
Но это были цветочки.
В журнале появилась задача. Вот:

if you come up with the best answer, you'll win £100 (or US$160) and see your answer published in a future issue of New Scientist. Tell us:
Fridge magnets must constantly overcome the force of gravity, which suggests they are expending energy. So why don't they run out of juice and fall off after a few years?

Меня здесь особенно умиляет слово suggests. Вообще-то, школьного учителя, который задаст такой вопрос в этой форме, со словом suggests, надо увольнять. Это не описание парадокса (которого и вовсе тут нету), а заведомо неверная подсказка, типа классического поворота на 180 градусов стоящего на подоконнике графина с водой и вопроса, почему у него тёплая та сторона, что в тени. Да нет, хуже даже: вопрос предполагает, что отвечающий просто не имеет ни малейшего представления о связи энергии с работой.
Редакторов журнала, мне кажется, тоже.

Жульё

Sep. 24th, 2013 12:01 pm
bgmt: (печать)
Открытое письмо ИОГен РАН с требованием опровержения несоответствующей действительности информации в фильме РенТВ

а также письмо А.М.Городницкого в связи с фильмом РенТв и другие материалы по реформе РАН


Я не стал перепощивать весь текст, потому что у многих лента будет заполнена одинаковыми перепостами. Однако я очень рекомендую пойти по ссылке.

К этому можно добавить три поста Еськова ([livejournal.com profile] afranius). Первый, продолжение истории во втором, а третий я процитирую:

И Ким. Он вернулся из канцелярии и принес огромную папку с доносами. Девяносто два доноса на меня, все написаны одним почерком и подписаны разными фамилиями. Что я ворую казенный сургуч на почте, и что я привез в чемодане
малолетнюю любовницу и прячу ее в подвале пекарни, и что я еще много чего... И Ким читал эти доносы и одни бросал в корзину, а другие откладывал в сторону, бормоча: "А это надо обмозговать..." И это было неожиданно и ужасно, бессмысленно и отвратительно...


Какое-то от этого кровожадненькое настроение возникает. Знаю, что нехорошо и не туда ведёт, но возникает. Ну не на фонарь, так хоть в дёгте.
bgmt: (Default)
via [livejournal.com profile] marina_p
с некоторым запозданием - так что наверно, большинство интересующихся уже видели - крайне интересное интервью Ю.И.Манина, взятое Михаилом Гельфандом (биологом, внуком И.М. Гельфанда, как мне тут указал [livejournal.com profile] xgrbml). (pdf). Очень, очень интересное.

Пара цитат:

"Очень условно говоря, во времена Ньютона, Эйлера, Лагранжа, Гаусса взаимодействие было настолько тесное, что одни и те же люди занимались математикой и физикой. Они могли себя считать больше математиками или больше физиками, но это были одни и те же люди. Это продолжалось где-то до конца XIX века. ХХ век начал обнаруживать существенную разницу. Поразительный пример – это история общей теории относительности. Эйнштейн не просто не знал математики, он не знал даже, что уже существует именно та математика, которая была нужна ему, когда в 1907 году он начал понимать физику общей теории относительности на своем гениально интуитивном языке. После нескольких лет, посвященных квантам, он вернулся к гравитации и в 1912 году написал своему другу, математику Марселю Гроссману: «Ты должен помочь мне, а не то я с ума сойду!». Их первая статья называлась так: «Набросок общей теории относительности и теории гравитации. I. Физическая часть Альберта Эйнштейна. II. Математическая часть Марселя Гроссмана». Эта попытка была все еще полуудача: найден правильный язык, но не правильные уравнения. К 1915 году уравнения были найдены, затем Гильберт выводит их из своего принципа действия – важность этой задачи, кажется, тоже ускользала от Эйнштейна… Увлекательная игра и сотрудничество великих интеллектов, вовлекшая историков в дурные споры о приоритете: сами главные герои были благородны и щедры на признание заслуг друг друга. "
[…]
"За это время кроме отдельных умов – фон Нойман несомненно был и физиком, и математиком, другого человека такого масштаба в ХХ веке я не знаю – в первой трети века математика и физика развивались параллельно и через некоторое время перестали обращать друг на друга внимание. В 40-х годах Фейнман написал свой замечательный континуальный интеграл как новое средство квантования, проработав его потрясающе математически, – вообразите себе что-то вроде Эйфелевой башни, которая висит в воздухе, без фундамента с точки зрения математики. Вот она вся есть, она вся работает, а стоит она неизвестно на чем. Это продолжается и по сей день. И когда в 50-е годы появились связности в расслоении и оказалось, что интеграл действия, из которого выводится уравнение для ядерных сил, грубо говоря, является давно известным из дифференциальной геометрии уравнением Янга-Миллса, тут математики начали коситься на физиков, а физики начали коситься на математиков. И оказалось парадоксальным и чрезвычайно для меня приятным образом, что мы стали учиться у физиков в большей степени, чем они у нас. Оказалось, что они с помощью квантовой теории поля и аппарата интеграла Фейнмана наработали мыслительные орудия, которые стали им позволять открывать один математический факт за другим. Не доказательства, а открытия. А дальше математики сидят, чешут голову и какие-то из этих открытий формулируют в виде теорем и пытаются их доказать нашими честными средствами. Это показывает, что то, что делают физики, действительно математически осмысленно – и физики говорят: «Мы всегда это знали, но, конечно, спасибо за внимание». Но вообще в результате мы научились у физиков, что надо спрашивать и какие предполагаются ответы – как правило, они оказываются правильными. Потом появляется Виттен, уникальное существо, человек-машина для производства великолепной математики из этой самой башни Эйфеля, висящей в воздухе. Я смотрел в Википедии: он кончал что-то неправдоподобное, то ли факультет журналистики, то ли юриспруденции, то ли еще что-то такое, потом занимался какой-то чепухой, а потом вдруг стал гениальным физиком. Причем таким физиком, что физики, связанные с экспериментом, жутко на него фырчат, косятся и прочее: не предсказал никакого спектра масс; все его предсказания относятся к моменту Большого взрыва, когда неизвестно, что было, и ничего измерить нельзя; все его универсальные законы работают в одиннадцатимерном пространстве; невероятное количество неизвестных параметров; и вообще – это не физика. Я в каком-то смысле даже и согласен. Это хозяин такого потрясающего ментального орудия, которое производит математику невероятной силы и мощи, но исходя из физической интуиции. Причем исходным материалом этой интуиции является не физический мир, а орудие, созданное Фейнманом, и разные его варианты и вариации – орудие вполне математическое, но не имеющее абсолютно никакого математического обоснования. Такой потрясающий эвристический принцип, но не мелочишка какая-то, а, я же говорю, огромное строение, только без фундамента. "

Ну и дальше...
bgmt: (Default)
via [livejournal.com profile] bakhtin, которому большое спасибо

Видеозапись 1981 года: http://videos.soulcravings.net/?p=16

Особо рекомендую юзеру [livejournal.com profile] mask_, в связи с разговором у [livejournal.com profile] marina_p.
bgmt: (Default)
Никогда бы не подумал, что прочту серьёзные, интересные и хорошо изложенные для неспециалистов вещи про природу математики и её место на сайте "Свободы", который вообще-то не отличался особенной научной культурой до сих пор. Тут, однако, они дали Фёдору Богомолову говорить, а не отвечать на дурацкие вопросы, и результат налицо. (Ну, конечно, всё равно текст Богомолова как бы принадлежит как бы автору интервью, Александру Костинскому - его фамилия фигурирует сверху текста. Но это уже придирки).

Profile

bgmt: (Default)
bgmt

March 2022

S M T W T F S
  1 2345
6789 101112
131415161718 19
20 212223242526
2728293031  

Syndicate

RSS Atom

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jun. 30th, 2025 08:52 pm
Powered by Dreamwidth Studios